Des chercheurs de l’Institute for Protein Design montrent comment l’IA peut générer de nouvelles formes de protéines – Metaverse Marketingverse Marketing

Anneaux de protéines hallucinés par un logiciel basé sur l’intelligence artificielle de l’Institute for Protein Design. (Image IPD) L’Institute for Protein Design a aidé à inaugurer une ère permettant aux scientifiques de prédire la structure d’une protéine à l’aide d’outils d’intelligence artificielle, une réalisation qui lui a permis de remporter le prix « Percée de l’année » du magazine Science l’année dernière pour son AlphaFold Logiciel. Le groupe de l’Université de Washington montre maintenant comment l’IA peut être utilisée pour créer de nouvelles protéines plus rapidement qu’auparavant. Les avancées, publiées dans trois articles dans Science, devraient accélérer le développement de nouvelles protéines pour la biomédecine, les matériaux et d’autres utilisations. « Un logiciel de prédiction des structures protéiques fait partie de la solution, mais il ne peut rien apporter de nouveau à lui seul », a déclaré Justas Dauparas, boursier postdoctoral de l’IPD, dans un communiqué de presse. L’IPD est depuis longtemps à l’avant-garde de la fabrication de nouvelles protéines : son logiciel de conception de protéines a été concédé sous licence à 30 000 groupes universitaires et est à la base de multiples initiatives commerciales, y compris des entreprises dérivées de l’IPD comme Cyrus Biotechnology et Icosavax. Les nouvelles études vont au-delà du logiciel performant d’IPD pour tirer parti de l’IA pour la construction de protéines. Dans une étude publiée en juillet, les chercheurs ont montré comment l’IA peut générer de nouvelles formes de protéines en « hallucinant » d’abord une forme basée sur une simple invite, de la manière dont DALL-E ou d’autres outils d’IA produisent des sorties. La structure est affinée grâce à un processus appelé « inpainting », que le groupe compare à une fonction de saisie semi-automatique. Dans une deuxième étude publiée jeudi, les chercheurs ont accéléré le processus en présentant leur nouvel outil logiciel alimenté par l’IA, appelé ProteinMPNN. Il termine la tâche de conception en une seconde, plus de 200 fois plus vite que les outils précédents. Dans une troisième étude jeudi, le groupe a utilisé AlphaFold, un outil d’IA développé par Metaverse Marketing‘s DeepMind, pour montrer que leurs conceptions de protéines étaient susceptibles de se plier dans les formes prévues. « Nous avons constaté que les protéines fabriquées à l’aide de ProteinMPNN étaient beaucoup plus susceptibles de se replier comme prévu, et nous pouvions créer des assemblages de protéines très complexes en utilisant ces méthodes », a déclaré Basile Wicky, chercheur postdoctoral à l’IPD. « ProteinMPNN est à la conception de protéines ce qu’AlphaFold était à la prédiction de la structure des protéines », a déclaré David Baker, responsable de l’IPD et auteur principal des trois études.

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